TurboSEQUEST® é um software para
identificação de proteínas por
comparação experimental de dados de espectrometria de
massa tandem (MS/MS) com proteínas padrões e base de
dados DNA.
Analyses "Shotgun" de baixas concentrações de
proteínas em misturas complexas
TurboSEQUEST® correlaciona entre si espectros de massa MS/MS
não interpretados de peptídeos de proteínas ou
base de dados de ácidos nucléicos. Ele determina a subseqüência de aminoácidos e portanto as
proteínas que correspondem ao espectro de massa do
peptídeo sendo analisado. O software pode analisar um
único espectro ou um mapa completo LC/MS/MS do peptídeo
automaticamente.
Uma característica particular do TurboSEQUEST® é
a capacidade de analisar diretamente proteínas em misturas.
Uma mistura de proteínas é digerida e então
analisada por uma técnica altamente específica de
espectrometria de massa tandem. A informação da
fragmentação gerada pelo experimento MS/MS é
convertida para a massa exata do peptídeo e
seqüência de informação. O algoritmo dentro
do TurboSEQUEST® pode extrair informação e
corretamente identificar baixas concentrações de
proteínas. Essa característica é especialmente
útil quando o tamanho das amostras de proteínas
é limitado e a razão sinal/ruído é baixa. | 
