Ferramenta de Identificação de Glicanos e Glicopeptídeos de Alto Rendimento usando Dados de Espectrometria de Massas
O SimGlycan prevê a estrutura dos glicanos a partir dos dados de MS/MS e espectrometria de massas (MSnu) em vários estágios. Além disso, o suporte abrangente para a resolução de glicopeptídeos usando dados de glicopeptídeos LC-MS/MS facilita os estudos de glicosilação.
O SimGlycan aceita dados experimentais de MS/MS, combina-os com seu próprio banco de dados e, finalmente, gera uma lista de estruturas candidatas classificadas. A classificação de cada candidato indica a proximidade entre a estrutura candidata e o glicano experimental. A classificação é calculada com base em um mecanismo de pontuação robusto que considera íons diagnósticos específicos da estrutura observados nos espectros experimentais de MS/MS, bem como a intensidade desses picos observados.
O SimGlycan também oferece suporte à análise de dados de espectrometria de massas (MSnu) em vários estágios para diferenciação de isômeros.
O banco de dados do SimGlycan contém 9.964 glicanos, 22.814 glicoproteínas, 6.826 glicanos com fontes biológicas conhecidas e 5.874 glicanos com classes conhecidas. O banco de dados é atualizado continuamente à medida que informações sobre glicanos adicionais são publicadas.
Entre em contato com os nossos vendedores, para que possamos juntos encontrarmos a melhor configuração para o seu laboratório e aplicação.
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